מבנה המוזיאון
תחנה ראשונה
מבואה
המבקרים יחזרו אחורה בזמן עד למרגלים מתקופת התנ"ך ויתקדמו עם השנים תוך שהם לומדים להכיר את ההיסטוריה המשפחתית של אלי כהן שהייתה הבסיס לערכים ולתרבות אליה נולד וגדל. החל מגירוש שורשי משפחתו מספרד לסוריה ועד להתמקמות הוריו באלכסנדריה שבמצרים. החיים בקהילה יהודית מסורתית וציונית במדינה ערבית, כאשר ברקע ראשית הציונות. אמצעי תצוגה- סרט אנימציה פנורמי המשלב תמונות היסטוריות תקופתיות ב- 360 מעלות.
תחנה שניה
גיבוש זהות יהודית וציונית
המבקרים נכנסים לעיר הולדתו של אלי כהן - אלכסנדריה שבמצרים, בה מתואר מהלך חייו של אלי הילד שגדל במשפחה מסורתית עם זהות יהודית ברורה, יונק תרבות קוסמופוליטית, לומד שפות ומתבלט בכישרונותיו. אלי הנער המצרי מגבש זהות ציונית המושפעת רבות ממלחמת העולם השנייה, הקמת המדינה השכנה ומלחמת העצמאות ובהיותו סטודנט הוא הופך לציוני פעיל בהעלאת יהודים לארץ, מתחבר לראשונה למודיעין הישראלי ועולה לישראל.
אמצעי תצוגה- תפאורה רב ממדית מדמה את נמל אלכסנדריה, בית משפחת כהן ובית הכנסת הגדול באלכסנדריה. אשליית הולוגרמה ממחישה את אמו של אלי כהן מנדנדת את עריסתו ושרה לו שיר ערש בלדינו, סרטים קצרים תקופתיים מוקרנים על גבי התפאורה ומוצגים מקוריים מפתיעים של אלי כהן הנחשפים לראשונה מתוך התפאורה, ביניהם: המזוודה של אלי כהן, הדרכון המצרי והטלית של אלי כהן שערה תהליך שימור מיוחד .
תחנה שלישית
משפחה והכשרה
הקהל מלווה את אלי כהן לאחר שעלה לישראל ומקים משפחה. נדיה כהן אלמנתו מספרת על ההיכרות עם אלי, החתונה, הילדים והחיים לצידו מתוך פנורמת ענק של החתונה ולצידה ויטרינה המאכלסת מוצגים מקוריים מבית משפחת כהן: תעודת הזהות של אלי כהן, תעודת הנישואין, תמונות מחתונה ועוד.
המבקרים עוברים לביתם של אלי ונדיה בבת-ים שם הם צופים במכונת התפירה המקורית- מתנתו של אלי לנדיה, המגהץ של אלי כהן, מכתב סיום קורס ההכשרה של אלי כסוכן ועוד מוצגים מקוריים.
על גבי מסכי ענק המשולבים בתפאורה חווים המבקרים את תקופת ההכשרה של אלי כלוחם מודיעין בישראל ובארגנטינה תוך שהוא מגבש זהות חדשה ולומד לפעול כסוכן בארץ זרה. פנורמת ענק של העיר בואנוס איירס והקרנה מיוחדת במינה מבעד למסך שקוף מאפשרת לצפות באלי כהן כאשליה של הולוגרמה בעודו יושב בבית קפה עם מפעילו תוך שהוא אוסף מידע.
תחנה רביעית
ריגול בדמשק
המבקרים נכנסים לחלל משוחזר כדירתו של אלי כהן בדמשק המכילה רהיטים דמשקאים מקוריים, תפאורה אותנטית, צילומי קיר ומוצגים מקוריים, באופן המייצר חוויה של הימצאות בדירה של אלי כהן. מסכים מוסווים המוחבאים בתפאורה יספרו לקהל על פעילותו בדמשק, סוריה, תחת זהותו החדשה ככאמל אמין ת'אבת.
הקרנת תמונות בני המשפחה על התקרה תאפשר לקהל לחוות את החיים הכפולים של הסוכן. המבקרים יחשפו לחלוק הבית המקורי ממשי שרכש אלי בסוריה ונשמר באופן מדהים בביתה של נדיה ועל קירות החדר מופיעים מסמכים חדשים שהמוסד מפרסם לראשונה ביניהם אישור העבודה בסוריה.
תחנה חמישית
מורס
דלת סתרים תפתח ותאפשר למבקרים לעבור לחדר סודי חבוי ובו תוצג אשליית הולוגרמה של אלי כהן על גבי מסך שקוף המשדר מידע לישראל באמצעות שימוש במכשיר מורס. קירות החדר והריהוט ישוו לחדר אופי של מזווה סמוי עם רהיטים דמשקאים. לכל אורך התחנה יוקרנו בני משפחתו של אלי כהן על התקרה גם כאן כאשליה של חיים כפולים.
תחנה שישית
גבורה והקרבה
המבקרים ייכנסו לחדר שבו תפאורת פנורמת ענק המתארת את מקום פועלו של אלי כהן ברמת הגולן הסורית ואת האיום המוחשי על המושבים והקיבוצים למרגלותיו. סרט פנורמי מרגש המשלב אנימציות, קטעי ארכיון, קטעי משחק, ראיונות, הקרנה על הרצפה והתקרה- יציג את הפעילות של אלי כהן ברמת הגולן בתקופת המלחמה על המים, ההתקפות על היישובים למרגלות הרמה, את ביקורו האחרון בארץ, את תפיסתו, מהלך משפטו, וגזר הדין. בחדר יוצגו המברקים המודיעיניים שאלי שלח ואת מכתביו לנדיה אשתו.
תחנה שביעית
חדר יזכור
הקהל יעבור על פני חדר "יזכור" שבו כל הקירות, התקרה והרצפה מחופים במראות. מנורת שבעת הקנים המיוצגת גם בסמל המוסד דולקת באמצע החדר ומייצרת השתקפות ותחושה של "אין סוף". סרט התלייה יוקרן במרכז החדר, תוך כדי שמיעת תפילת האשכבה.
תחנה שמינית
מורשת והנצחה
המבקרים יחזרו לאולם המבואה, לצפייה בסרט סיכום ב- 360 מעלות כולל הקרנה על תקרה המתאר את השפעתו העצומה של אלי כהן על תוצאת מלחמת ששת הימים ויזכיר למבקרים כי גם בימים אלה יש לוחמות ולוחמים המסכנים את נפשם לביצור בטחונה של ישראל. מפעל ההנצחה המרשים למורשת אלי כהן הקיים בכל הארץ אותו מובילה נדיה אשתו, יוצג באופן פנורמי ומרגש. עם סיום ההקרנה, ייחשפו למבקרים- השעון של אלי כהן, תיבת התכשיטים שרכש לנדיה, החפתים שלו ומכתבים מקוריים מראשי המוסד וראשי הממשלה לאורך השנים.